1989年卡洛斯·克莱伯的第一次维也纳新年音乐会由CBS抢得了唱片发行权，自此也拉开了新年音乐会实况录音“群雄逐鹿”的时代。对于这场精彩程度不亚于1987年的难忘演出，CBS慷慨地以双CD形式收录了全部16首演出曲目。但CBS很快就被SONY所收购，在完成这笔交易后，SONY以自己的新商标重新再版了1989年的实况录音，而且还先后发了单碟和双碟两个版本；在单碟版中这位新东家“残忍”地把那首演得很好的《如同在家圆舞曲》去掉了。新老版本一脉相承的则是在封面设计上，对于指挥家个人形象的突出，潇洒的小克莱伯无疑成为了明星式的人物。
1990年元旦，祖宾·梅塔首次在维也纳新年音乐会上登台，SONY顺理成章地获得唱片发行权。老实讲，这套唱片的录音并不成功，整体音色偏薄；SONY依然延续单碟发售，因此不得不割舍苏佩的《维也纳的早中晚序曲》和小约翰·施特劳斯的《毁灭者波尔卡》。这一年的唱片封面记录了当年演出完《爆炸波尔卡》后纸片飞散的难忘场景。
1991年阿巴多的第二次新年音乐会实况由DG出品，录音效果非常出色，不过这也是经典的“DG大黄标”最后一次出现在维也纳新年音乐会实况录音的封面上。由于也是单碟发行，曲目缺失的遗憾不可避免，这一年“中招”的是开场的罗西尼《贼鹊序曲》以及下半场上演的老约翰·施特劳斯作品《比夫克与普夫克波尔卡》。
1992年的维也纳新年音乐会因小克莱伯的二度登台而备受关注，指挥家则延续了自己在演绎维也纳舞曲时那令人耳目一新的速度和节奏；所幸这次SONY带来的声音效果要比1990年那次有明显进步，听上去更加均衡自然，由此成就了一套好唱片。在演出《游览列车》时候，小克莱伯亲自吹响了模拟列车汽笛的小喇叭，唱片封面上的照片记录了这令人莞尔的瞬间。为了确保单碟发行，发行方只能舍弃两首波尔卡舞曲——上半场的《铁匠》和下半场的《骑手》。
在此之后，唱片公司曾推出了一套3CD的“1989+1992合集”，但并未涵盖1992年所有的演出曲目，两首波尔卡依然缺席。2005年索尼再版了1992年实况的SACD版，可仍然没有集齐全部作品。
伴随着里卡多·慕蒂在1993年元旦第一次指挥维也纳新年音乐会，PHILIPS公司也首度获得这台年度音乐盛会实况录音的出版发行。我们会发现这一年的声音风格与之前几年都不一样，虽然录制清晰而热烈，但声音略有些干涩，打击乐听上去似乎有些“冲”。好在慕蒂的演出极为成功，留下了包括《埃及进行曲》在内的好几首典范级演绎，唱片还保留了慕蒂带领乐团全体成员向听众致新年问候的片段，甚至连来自观众的“还礼”也没有切掉。最大的遗憾则还是因为单碟的篇幅限制，没能将音乐会后广受赞誉的《柠檬树花开的地方圆舞曲》收录进来（这是该曲继1988年之后第二度无缘年度实况录音）。PHILIPS为这套唱片设计了两个封面，分别记录了当年音乐会现场那两朵巨大的“蘑菇”和火爆至极的《在猎场上（狩猎）快速波尔卡》之后漫天彩纸的画面。
1994年马泽尔重返维也纳，标志着新年音乐会“3M时代”的开启；连同1995年梅塔的第二次亮相，这两年的演出实况均由SONY发行，因此在录音质量上两者保持着高度一致——清丽而明快，而且富有层次感和空间感。不过这两次音乐会上的两部重量级作品均与当年发行的实况录音唱片无缘——1994年小约翰·施特劳斯的《威尼斯之夜序曲》（维也纳首演版）以及1995年约瑟夫·施特劳斯的《维也纳的儿童圆舞曲》，这两首作品在之后很长一段时间内都未重演，加之这两年的演出也没有发行过影碟，所以曲目被排除在唱片之外就尤为可惜。好在SONY在2015年发行的《维也纳新年音乐会75周年纪念专辑》中让封存多年的1995年版《维也纳的儿童》重见天日，而杨松斯也在2016年的新年音乐会上再度演出维也纳首演版的《威尼斯之夜序曲》。
1996年是RCA品牌首次出现在维也纳新年音乐会实况录音唱片上，听众们得以从中领略到属于RCA的美式录音特点，与SONY的清丽明快不同，RCA所呈现出的声音风格显得更为厚重和粗犷，混响相对较大，优点是听起来气势十足，缺点是失去了些许细节，当然这也是一把“双刃剑”，对于不同题材和格调的作品可谓有得有失。同样是马泽尔棒下的维也纳爱乐乐团，1994年的实况和1996年的实况听上去有着十分鲜明的差别。RCA比较厚道的一点在于他们打破了单碟的限制，双CD完整记录了全部16首曲目，后来又发行过一张单碟的版本，将之列入“RCA RED SEAL BEST 100”系列中。值得一提的是，双碟版的1996年唱片封面其实使用的是1994年元旦现场的照片，虽然马泽尔身着款式完全相同的演出服指挥了这两年的新年音乐会，但封面右下角指挥台前的花束造型暴露了“移花接木”的事实；而且有意思的是，封面设计师对马泽尔的衣装进行了“PS”，把原本灰色的西装马甲给染成了黑色，不知是何用意？
慕蒂在1997年的第二场维也纳新年音乐会由EMI发行，唱片公司推出了两种版本。先期推出的那个版本的封面显然与演出现场的实际不符，而后发行的百年纪念版封面则使用了1997年元旦当天拍摄的照片。可以肯定的是，发行方为了让唱片尽快上市，必须提前把整个封套设计妥当，因此不能像之前几年那样使用演出当天的现场照片来作为封面背景，这种做法自1996年开始，并逐渐为各大唱片公司所沿用，这让实况录音唱片能及早面世的同时，也直接导致了后面的诸多“洋相”。
这一年指挥和乐团临时更换了下半场演出的曲目顺序，由于EMI已经提前设计好了封套和文案，只能在编辑时仍然按照原来的演出计划对音轨进行调整，所以录音唱片与实际演出的曲目先后存在一部分出入（譬如《神秘的引力圆舞曲》实际演出被安排在下半场第二首，但在唱片中却是下半场第八首），也是无奈之举。
1998年，梅塔第三度登台，获得实况录音发行权的RCA将他们那雄浑厚实的音色发挥到极致，开场的《旗帜飘扬进行曲》几乎是“轰鸣而出”，可以肯定这是录音师、混音师刻意拉高了电平，同时你又不得不承认这种录音风格太适合这首作品了。RCA带来的这种音色未必每位听众都喜欢，但由不同录音品牌带来的这种声音风格的切换却是很有意思的；随着发行版权的集中加之制作流程的因素，如今人们已经很难在新的维也纳新年音乐会实况录音中体验到这种变化了。这一年的唱片封面又出了一个小洋相，梅塔背后的乐团里出现了首席Werner Hink的身影，但实际上这一年他并没有参加元旦的演出，当天音乐会乐团的首席是Rainer Kuchl。
RCA在推出1999年实况录音时，在唱片盒外面额外附加了一个硬纸封套，所以我们会看到两个封面。在唱片盒内的封面上，他们继续“犯错”——出现在元旦当天音乐会演出现场的乐队首席是Werner Hink，但我们从实况录音封面上却看到了实际没有参加演出的Rainer Kuchl（他们二位这么一进一出也算扯平了）；其实从背景照片上的鲜花布置可以知晓，那张衬底的背景是1996年（也就是马泽尔上一次登台时）拍摄的照片，指挥家本人拉琴的形象也应该是三年前的留影。可惜这一年RCA没有为消费者带来完整的录音，随着新年音乐会演出曲目越来越多，单碟容量仅够容纳全部19首演出曲目中的14首。不过唱片公司此后又发行了一套名为《Valses Du Nouvel An》的专辑，放入了《为弗兰茨·约瑟夫皇帝获救而欢呼进行曲》、《一心一意玛祖卡波尔卡》、《别客气法兰西波尔卡》、《荒诞玛祖卡波尔卡》以及《蝙蝠四对舞》这五首1999年实况录音单行本里没有的曲目，也算是生财有道。
2000年的维也纳新年音乐会从各个方面来看都不算十分成功，一方面大病初愈的慕蒂并不在最佳状态，另一方面EMI发行的实况在声音效果也广受诟病——录音显得有些干瘪和空洞。不过这一年的演出里还是有少数值得珍藏的曲目，譬如上半场小约翰的《爱之歌圆舞曲》以及下半场约瑟夫的《圣母之声圆舞曲》。
2001年因为哈农库特的首度亮相，TELDEC获得了维也纳新年音乐会实况的录音和发行权，指挥家、乐团和唱片公司联袂为听众们带来了一套出色的唱片。哈农库特充满新意又兼顾传统的诠释方法获得了广泛的好评，TELDEC的录音效果也受到了发烧友们充分的肯定，其均衡而自然的音效无疑是具有示范价值的。这是TELDEC唯一一次出品维也纳新年音乐会的实况录音唱片，在一年之后他们便被华纳集团放弃了，好在整个录音团队被以“TELDEX Studio Berliner”的名义保留下来，并且参与了之后很多届维也纳新年音乐会CD唱片的录制工作；2001年唱片的录音制作人Friedemann Engelbrecht此后也多次出任这一关键职务，甚至被认为是维也纳新年音乐会实况录音音效的坚实保障。这一年唱片封面上的照片是在演出排练时提前拍摄的，至少没有露出太明显的破绽。
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